Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ApcsP12246 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ApcsP12246 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms