Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga5P11688 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms