Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema3aO08665 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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