Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sec22bO08547 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sec22bO08547 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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