Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm379J3QQ19 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms