Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc163A2AGD7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms