Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt27Q9Z320 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms