Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS3Q9UPU3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS3Q9UPU3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms