Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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