Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Homer2Q9QWW1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms