Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pole3Q9JKP7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pole3Q9JKP7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms