Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmbr1Q9JIT0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms