Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl28Q9JIL2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl28Q9JIL2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl28Q9JIL2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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