Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn12Q9ER56 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms