Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rhox9Q9EQM5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rhox9Q9EQM5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms