Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SrpraQ9DBG7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms