Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cmtr1Q9DBC3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms