Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smurf1Q9CUN6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms