Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tm4sf20Q9CQY8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms