Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Mrpl35Q9CQL6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl35Q9CQL6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Mrpl35Q9CQL6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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