Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NenfQ9CQ45 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NenfQ9CQ45 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NenfQ9CQ45 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NenfQ9CQ45 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NenfQ9CQ45 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NenfQ9CQ45 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms