Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smtnl1Q99LM3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smtnl1Q99LM3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms