Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc30a1Q99J38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttc30a1Q99J38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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