Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf183Q8QZS5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rnf183Q8QZS5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rnf183Q8QZS5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf183Q8QZS5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms