Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim68Q8K243 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim68Q8K243 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim68Q8K243 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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