Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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