Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RybpQ8CCI5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms