Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp38Q8BW70 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp38Q8BW70 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms