Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Spock3Q8BKV0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spock3Q8BKV0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms