Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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