Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nop58Q6DFW4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nop58Q6DFW4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms