Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam208bQ5DTT3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam208bQ5DTT3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms