Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rhox3aQ4TU90 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rhox3aQ4TU90 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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