Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc162pQ0VG85 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms