Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms