Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ptprn2P80560 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprn2P80560 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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