Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gfi1P70338 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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