Protein–RNA interactions for Protein: P62956

Cacng7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng7P62956 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cacng7P62956 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms