Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms