Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PltpP55065 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PltpP55065 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PltpP55065 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms