Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Hoxc11P31313 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc11P31313 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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