Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms