Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Xrcc5P27641 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xrcc5P27641 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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