Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vpreb2P13373 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms