Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc8P09025 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc8P09025 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms