Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TtrP07309 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TtrP07309 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TtrP07309 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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