Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Psmb10O35955 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb10O35955 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Psmb10O35955 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Psmb10O35955 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Psmb10O35955 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Psmb10O35955 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Psmb10O35955 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Psmb10O35955 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Psmb10O35955 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms