Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FxnO35943 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FxnO35943 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FxnO35943 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FxnO35943 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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FxnO35943 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FxnO35943 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FxnO35943 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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