Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm21060J3KMU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm21060J3KMU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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