Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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